在卫生部的中医针灸师证考试中，主要考察了以下几个科目：

1、中医基础理论：这部分主要测试考生对中医基本理论的理解和掌握程度，包括阴阳五行学说、脏腑经络学说、气血津液学说、病因病机学说等，还会涉及中医诊断的基本原则和方法，如望闻问切四诊合参、辨证论治等。

2、中药学：这部分主要测试考生对中药的基本知识、性质、功效、配伍禁忌等方面的掌握程度，需要熟悉常用的中药材种类、性味归经、药理作用、临床应用等内容，还会涉及到中药炮制、制剂工艺等方面的知识。

3、针灸技术：这部分主要测试考生对针灸技术的熟练程度和操作规范，包括毫针、刺络、拔罐、刮痧等各种针灸技法的操作方法和注意事项，还会涉及到针灸治疗的原则、适应症、禁忌症等方面的知识。

4、推拿按摩：这部分主要测试考生对推拿按摩的基本理论和操作技能，包括推拿手法的基本分类、操作方法和注意事项；按摩常用穴位及其功能；推拿按摩在常见病、多发病治疗中的应用等。

5、中西医结合：这部分主要测试考生对中西医结合的理论体系和实践经验的掌握程度，需要熟悉西医疾病分类、病因病机、诊断治疗等方面的知识，以及中医治疗方法的优势和局限性，还会涉及到中西医结合治疗方案的制定和实施等方面的内容。

6、法律法规：这部分主要测试考生对中医药相关法律法规的了解和运用能力，包括《中华人民共和国中医药法》、《中华人民共和国药品管理法》等法律法规的基本内容，以及中医药行业监管、医疗责任等方面的法律规定。

为了顺利通过卫生部的中医针灸师证考试，考生需要在以上几个科目上进行全面、系统的学习和准备，可以通过阅读专业教材、参加培训课程、实践操作等多种途径来提高自己的理论水平和实际操作能力，注重积累临床经验，了解各种疾病的诊断和治疗方法，以便在考试中能够灵活运用所学知识。