中医针灸师证办理机构主要分布在全国各地，包括北京、上海、广州、深圳等大城市，以及一些中小城市，以下是一些主要的办理机构：

1、北京中医药大学针灸推拿学院：这是国内最权威的针灸推拿教育机构，也是中医针灸师证的主要办理机构之一，该学院有专门的教师团队，负责针灸推拿的教学和研究工作，同时也负责中医针灸师证的颁发工作。

2、上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院：该医院是上海市重点支持的中西医结合医院，也是中医针灸师证的主要办理机构之一，该医院有专门的中医药管理部门，负责中医药的管理和服务工作，同时也负责中医针灸师证的颁发工作。

3、广州中医药大学第一附属医院：该医院是广东省重点支持的西医结合医院，也是中医针灸师证的主要办理机构之一，该医院有专门的中医科，负责中医药的治疗和服务工作，同时也负责中医针灸师证的颁发工作。

4、深圳市中医院：该医院是深圳市重点支持的中西医结合医院，也是中医针灸师证的主要办理机构之一，该医院有专门的中医药管理部门，负责中医药的管理和服务工作，同时也负责中医针灸师证的颁发工作。

除了以上这些大型医院外，还有一些专业的培训机构也提供中医针灸师证的培训和考试服务，北京市中医药职业技能培训中心、上海市中医药职业技能培训中心等。

在办理中医针灸师证的过程中，需要提交相关的材料，包括身份证、学历证明、职业资格证书等，还需要参加专业的培训和考试，通过考试后才能获得中医针灸师证。

办理中医针灸师证需要找到正规的办理机构，提交相关的材料，参加专业的培训和考试，只有通过这些步骤，才能获得中医针灸师证。