营养健康师的证书颁发主要由以下几个部门或机构进行：

政府主管部门：在很多国家和地区，例如中国，美国，澳大利亚等，政府都会设立专门的部门或机构来负责营养健康师的资格认证工作，这些机构会制定统一的考试标准和课程要求，只有通过考试并满足一定学分要求的人员，才能获得营养健康师的资格证书。

专业学会或协会：很多营养健康相关的专业学会或协会也会颁发营养健康师的证书，这些组织通常会对会员进行严格的资质审核，确保会员具备一定的专业知识和实践经验。

教育机构：一些大学或职业学校开设有营养健康相关的课程，完成学习并通过考核的学生，可以获得学校颁发的营养健康师证书。

私人机构：除了政府部门和专业组织外，还有一些私人机构提供营养健康师的培训和认证服务，这些机构的服务内容和标准可能因机构而异，需要考生根据自身需求进行选择。

无论证书由哪个部门或机构颁发，考生都需要满足一定的学分要求，通过相应的考试，并经过专业审核，才能获得证书，营养健康师的职责不仅仅是传授知识，更重要的是运用所学知识指导个人的健康管理，帮助人们改善饮食习惯，提高生活质量，营养健康师需要具备扎实的专业知识，良好的沟通能力，以及对健康的热爱和责任感。