针灸师证和针灸门诊证是两个不同的概念，针灸师证是指具有一定的中医理论知识和临床实践能力，能够独立开展针灸治疗工作的医师资格证书，而针灸门诊证是指在医疗机构内开设针灸门诊的医师执业许可证。

如果您已经取得了针灸师证，那么您可以在医疗机构内开设针灸门诊，具体的办理流程和要求可能因地区而异，建议您咨询当地的卫生行政部门或者相关协会了解具体情况。

至于费用方面，由于不同地区、不同机构的收费标准不同，因此无法给出具体的数字，办理针灸门诊证需要缴纳一定的费用，并且还需要参加相关的培训和考试。